Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RYBPQ8N488 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RYBPQ8N488 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYBPQ8N488 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYBPQ8N488 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms