Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LNX2Q8N448 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNX2Q8N448 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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