Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLGN4XQ8N0W4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLGN4XQ8N0W4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms