Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ1

WDFY3, WD repeat and FYVE domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY3Q8IZQ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDFY3Q8IZQ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDFY3Q8IZQ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDFY3Q8IZQ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDFY3Q8IZQ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDFY3Q8IZQ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDFY3Q8IZQ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDFY3Q8IZQ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDFY3Q8IZQ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDFY3Q8IZQ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDFY3Q8IZQ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDFY3Q8IZQ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms