Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPAS3Q8IXF0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPAS3Q8IXF0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms