Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC6Q8IVU3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC6Q8IVU3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HERC6Q8IVU3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERC6Q8IVU3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms