Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT12Q8IV01 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SYT12Q8IV01 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 416.7 ms