Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR0

TRAPPC5, Trafficking protein particle complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5Q8IUR0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC5Q8IUR0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC5Q8IUR0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC5Q8IUR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms