Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS6Q8IU80 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS6Q8IU80 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS6Q8IU80 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS6Q8IU80 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms