Protein–RNA interactions for Protein: Q86YT6

MIB1, E3 ubiquitin-protein ligase MIB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB1Q86YT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIB1Q86YT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIB1Q86YT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIB1Q86YT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms