Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIBP1Q86W92 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIBP1Q86W92 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIBP1Q86W92 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 444.4 ms