Protein–RNA interactions for Protein: Q86W28

NLRP8, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP8Q86W28 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP8Q86W28 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP8Q86W28 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP8Q86W28 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms