Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD163Q86VB7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD163Q86VB7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms