Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF554Q86TJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF554Q86TJ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms