Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP0

NIPA1, Magnesium transporter NIPA1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA1Q7RTP0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NIPA1Q7RTP0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NIPA1Q7RTP0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NIPA1Q7RTP0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms