Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST9Q7L1S5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST9Q7L1S5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CHST9Q7L1S5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms