Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP34Q70CQ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP34Q70CQ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP34Q70CQ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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