Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPGS1Q6ZTW0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPGS1Q6ZTW0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms