Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSZ5

ARHGEF18, Rho guanine nucleotide exchange factor 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF18Q6ZSZ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF18Q6ZSZ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF18Q6ZSZ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF18Q6ZSZ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF18Q6ZSZ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGEF18Q6ZSZ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms