Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC73Q6ZRK6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC73Q6ZRK6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms