Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms