Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C19orf48Q6RUI8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf48Q6RUI8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C19orf48Q6RUI8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf48Q6RUI8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms