Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRAT1Q6PJG6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRAT1Q6PJG6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms