Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C22orf39Q6P5X5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C22orf39Q6P5X5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms