Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXS1

PPP1R2P3, Protein phosphatase inhibitor 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R2P3Q6NXS1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R2P3Q6NXS1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R2P3Q6NXS1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R2P3Q6NXS1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R2P3Q6NXS1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R2P3Q6NXS1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R2P3Q6NXS1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R2P3Q6NXS1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R2P3Q6NXS1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R2P3Q6NXS1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R2P3Q6NXS1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R2P3Q6NXS1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R2P3Q6NXS1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP1R2P3Q6NXS1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.7 ms