Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTL6Q6ICC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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RTL6Q6ICC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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RTL6Q6ICC9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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RTL6Q6ICC9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL6Q6ICC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL6Q6ICC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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