Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NCAPH2Q6IBW4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCAPH2Q6IBW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPH2Q6IBW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPH2Q6IBW4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPH2Q6IBW4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPH2Q6IBW4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPH2Q6IBW4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPH2Q6IBW4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPH2Q6IBW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPH2Q6IBW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms