Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RALGAPA1Q6GYQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALGAPA1Q6GYQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms