Protein–RNA interactions for Protein: Q68CL5

TPGS2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS2Q68CL5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPGS2Q68CL5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPGS2Q68CL5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPGS2Q68CL5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms