Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B1

RNF219, RING finger protein 219, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF219Q5W0B1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF219Q5W0B1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF219Q5W0B1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF219Q5W0B1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms