Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHEQ5VZ18 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SHEQ5VZ18 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms