Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP40Q5TG30 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP40Q5TG30 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms