Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEPDC1Q5TB30 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms