Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM78Q5T7P6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM78Q5T7P6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM78Q5T7P6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 487.5 ms