Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
L1TD1Q5T7N2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
L1TD1Q5T7N2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
L1TD1Q5T7N2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
L1TD1Q5T7N2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
L1TD1Q5T7N2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
L1TD1Q5T7N2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
L1TD1Q5T7N2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
L1TD1Q5T7N2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
L1TD1Q5T7N2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
L1TD1Q5T7N2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
L1TD1Q5T7N2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
L1TD1Q5T7N2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms