Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSL3PQ5NE16 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSL3PQ5NE16 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms