Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAVIN4Q5BKX8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAVIN4Q5BKX8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CAVIN4Q5BKX8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms