Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC178Q5BJE1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC178Q5BJE1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC178Q5BJE1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC178Q5BJE1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC178Q5BJE1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC178Q5BJE1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC178Q5BJE1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC178Q5BJE1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC178Q5BJE1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC178Q5BJE1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC178Q5BJE1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC178Q5BJE1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms