Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM41BQ5BJD5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM41BQ5BJD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM41BQ5BJD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM41BQ5BJD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM41BQ5BJD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM41BQ5BJD5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM41BQ5BJD5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms