Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDK2Q58EX2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SDK2Q58EX2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDK2Q58EX2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216 ms