Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC39A12Q504Y0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC39A12Q504Y0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC39A12Q504Y0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC39A12Q504Y0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC39A12Q504Y0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC39A12Q504Y0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC39A12Q504Y0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC39A12Q504Y0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC39A12Q504Y0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC39A12Q504Y0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC39A12Q504Y0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms