Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FNDC1Q4ZHG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FNDC1Q4ZHG4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC1Q4ZHG4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms