Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYTL3Q4VX76 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYTL3Q4VX76 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYTL3Q4VX76 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms