Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MINDY4Q4G0A6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY4Q4G0A6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MINDY4Q4G0A6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY4Q4G0A6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY4Q4G0A6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms