Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCU0

Putative uncharacterized protein FLJ37770, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3ZCU0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3ZCU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Q3ZCU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q3ZCU0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3ZCU0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3ZCU0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3ZCU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3ZCU0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3ZCU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3ZCU0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3ZCU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3ZCU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3ZCU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3ZCU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms