Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLA2G4EQ3MJ16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLA2G4EQ3MJ16 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLA2G4EQ3MJ16 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLA2G4EQ3MJ16 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLA2G4EQ3MJ16 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLA2G4EQ3MJ16 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLA2G4EQ3MJ16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLA2G4EQ3MJ16 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLA2G4EQ3MJ16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLA2G4EQ3MJ16 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLA2G4EQ3MJ16 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLA2G4EQ3MJ16 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLA2G4EQ3MJ16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLA2G4EQ3MJ16 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLA2G4EQ3MJ16 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLA2G4EQ3MJ16 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLA2G4EQ3MJ16 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLA2G4EQ3MJ16 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms