Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDRF1Q3B7T1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EDRF1Q3B7T1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDRF1Q3B7T1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDRF1Q3B7T1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms