Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDKN3Q16667 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN3Q16667 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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