Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIL3Q16649 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NFIL3Q16649 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIL3Q16649 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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