Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX1Q16384 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX1Q16384 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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